С 2000 по 2003 годы Виген Саркисян служил в рядах Вооруженных сил Армении, занимая пост референта министра обороны. Министр обороны Армении Виген Саркисян на встрече с руководителями армянских СМИ признался, что у него сформировался комплекс, связанный с тем, что он не служил непосредственно в войсках.
По словам министра, он считает несправедливым постановку вопроса таким образом, что он не служил в войсках, так как неправильно ставить различие между срочной службой рядового и офицера.
Он отметил, что три года находился на службе в качестве офицера там, где решило руководство, однако, несмотря на это, у него имеется комплекс. "Я служил три года. И да, у меня есть комплекс, что не служил в войсках", — сказал Саркисян. Президент Армении Серж Саргсян подписал указ о назначении Вигена Саркисяна на должность министра обороны республики в начале октября. Ранее Саркисян занимал должность руководителя аппарата главы государства.